MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015942	GATG	2	8	255212	255219	25 %	25 %	50 %	0 %	344198474
5502	NC_015942	ACC	2	6	255225	255230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198474
5503	NC_015942	GCC	3	9	255264	255272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198474
5504	NC_015942	ATC	2	6	255328	255333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198474
5505	NC_015942	GCCA	2	8	255366	255373	25 %	0 %	25 %	50 %	344198474
5506	NC_015942	TGA	2	6	255374	255379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198474
5507	NC_015942	GGC	2	6	255390	255395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198474
5508	NC_015942	GCG	2	6	255436	255441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198474
5509	NC_015942	GTG	2	6	255442	255447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198474
5510	NC_015942	GC	3	6	255462	255467	0 %	0 %	50 %	50 %	344198474
5511	NC_015942	CGA	2	6	255512	255517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198474
5512	NC_015942	CATT	2	8	255526	255533	25 %	50 %	0 %	25 %	344198474
5513	NC_015942	TGT	2	6	255545	255550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198474
5514	NC_015942	CGG	2	6	255578	255583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198474
5515	NC_015942	GAC	2	6	255651	255656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198474
5516	NC_015942	TGC	2	6	255690	255695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198474
5517	NC_015942	GAA	2	6	255744	255749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_015942	TCC	2	6	255752	255757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5519	NC_015942	GGT	2	6	255776	255781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_015942	CAT	2	6	255807	255812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198475
5521	NC_015942	CAT	2	6	255933	255938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198475
5522	NC_015942	CCA	2	6	255978	255983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198475
5523	NC_015942	CCG	2	6	256071	256076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198475
5524	NC_015942	CAT	2	6	256092	256097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198475
5525	NC_015942	TAG	2	6	256278	256283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198476
5526	NC_015942	A	6	6	256312	256317	100 %	0 %	0 %	0 %	344198476
5527	NC_015942	GCC	2	6	256318	256323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198476
5528	NC_015942	GGC	2	6	256483	256488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198476
5529	NC_015942	TGG	2	6	256500	256505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198476
5530	NC_015942	GTA	2	6	256525	256530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198476
5531	NC_015942	TGC	2	6	256590	256595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198476
5532	NC_015942	GGA	2	6	256657	256662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198476
5533	NC_015942	CAC	2	6	256692	256697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198476
5534	NC_015942	AC	3	6	256707	256712	50 %	0 %	0 %	50 %	344198476
5535	NC_015942	TGTT	2	8	256718	256725	0 %	75 %	25 %	0 %	344198476
5536	NC_015942	CAT	2	6	256779	256784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198476
5537	NC_015942	TTG	2	6	256838	256843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198476
5538	NC_015942	GTCG	2	8	256957	256964	0 %	25 %	50 %	25 %	344198476
5539	NC_015942	GGGCA	2	10	256987	256996	20 %	0 %	60 %	20 %	344198476
5540	NC_015942	CCTG	2	8	257066	257073	0 %	25 %	25 %	50 %	344198476
5541	NC_015942	TTC	2	6	257099	257104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198476
5542	NC_015942	GAT	2	6	257107	257112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198476
5543	NC_015942	CGG	2	6	257133	257138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198476
5544	NC_015942	TTG	2	6	257147	257152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198476
5545	NC_015942	TTG	2	6	257177	257182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198476
5546	NC_015942	ATC	2	6	257297	257302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198476
5547	NC_015942	GAT	2	6	257332	257337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198476
5548	NC_015942	T	6	6	257354	257359	0 %	100 %	0 %	0 %	344198476
5549	NC_015942	CAC	2	6	257510	257515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_015942	AGG	2	6	257554	257559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198477
5551	NC_015942	CAT	2	6	257602	257607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198477
5552	NC_015942	CGG	2	6	257735	257740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198477
5553	NC_015942	TTG	2	6	257759	257764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344198477
5554	NC_015942	TCA	2	6	257799	257804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198477
5555	NC_015942	CGT	2	6	257825	257830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198477
5556	NC_015942	GA	3	6	257886	257891	50 %	0 %	50 %	0 %	344198477
5557	NC_015942	GAT	2	6	257983	257988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198477
5558	NC_015942	ATC	2	6	258077	258082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198477
5559	NC_015942	CTGG	2	8	258088	258095	0 %	25 %	50 %	25 %	344198477
5560	NC_015942	TGGC	2	8	258111	258118	0 %	25 %	50 %	25 %	344198477
5561	NC_015942	CAG	2	6	258128	258133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198477
5562	NC_015942	T	7	7	258306	258312	0 %	100 %	0 %	0 %	344198477
5563	NC_015942	AGTAG	2	10	258319	258328	40 %	20 %	40 %	0 %	344198477
5564	NC_015942	G	6	6	258337	258342	0 %	0 %	100 %	0 %	344198477
5565	NC_015942	GCT	3	9	258415	258423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198477
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5569	NC_015942	GCGG	2	8	258481	258488	0 %	0 %	75 %	25 %	344198477
5570	NC_015942	GGC	2	6	258524	258529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198477
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5575	NC_015942	CATGGT	2	12	258707	258718	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344198477
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5579	NC_015942	TGA	2	6	258898	258903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198477
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5582	NC_015942	GGC	2	6	258953	258958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198477
5583	NC_015942	CG	3	6	258984	258989	0 %	0 %	50 %	50 %	344198477
5584	NC_015942	GATA	2	8	259070	259077	50 %	25 %	25 %	0 %	344198478
5585	NC_015942	GCGG	2	8	259095	259102	0 %	0 %	75 %	25 %	344198478
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5589	NC_015942	AAT	2	6	259250	259255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344198478
5590	NC_015942	TGC	2	6	259312	259317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198478
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5592	NC_015942	A	6	6	259380	259385	100 %	0 %	0 %	0 %	344198478
5593	NC_015942	TGA	2	6	259424	259429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198478
5594	NC_015942	GAT	2	6	259431	259436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198478
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5597	NC_015942	TGC	2	6	259520	259525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198478
5598	NC_015942	CATC	2	8	259532	259539	25 %	25 %	0 %	50 %	344198478
5599	NC_015942	TGGGG	2	10	259565	259574	0 %	20 %	80 %	0 %	344198478
5600	NC_015942	CTG	2	6	259575	259580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198478
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5604	NC_015942	CAG	2	6	259755	259760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198478
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5606	NC_015942	GGC	2	6	259812	259817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198478
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5615	NC_015942	TTA	2	6	260355	260360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_015942	GCG	2	6	260385	260390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_015942	GGT	2	6	260404	260409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_015942	TCCC	2	8	260465	260472	0 %	25 %	0 %	75 %	344198479
5619	NC_015942	GAT	2	6	260525	260530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198479
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5622	NC_015942	TCG	2	6	260712	260717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198479
5623	NC_015942	TTC	2	6	260730	260735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198479
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5648	NC_015942	ATG	2	6	262030	262035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344198480
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5685	NC_015942	CGT	2	6	264143	264148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5686	NC_015942	GCG	2	6	264196	264201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5687	NC_015942	CAGTG	2	10	264203	264212	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5688	NC_015942	A	6	6	264295	264300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5689	NC_015942	A	7	7	264314	264320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5690	NC_015942	GAG	3	9	264350	264358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5691	NC_015942	GCT	2	6	264417	264422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198481
5692	NC_015942	GCT	2	6	264425	264430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198481
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5699	NC_015942	TGC	2	6	264748	264753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198482
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5707	NC_015942	TGCCCT	2	12	264964	264975	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	344198482
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5710	NC_015942	GTC	2	6	265108	265113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198482
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5726	NC_015942	CTGG	2	8	265571	265578	0 %	25 %	50 %	25 %	344198483
5727	NC_015942	GAA	2	6	265629	265634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344198483
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5732	NC_015942	CCGT	2	8	265950	265957	0 %	25 %	25 %	50 %	344198483
5733	NC_015942	GGA	2	6	266019	266024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344198483
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5739	NC_015942	GCA	2	6	266318	266323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198483
5740	NC_015942	CAG	2	6	266337	266342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198483
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5742	NC_015942	CCA	2	6	266396	266401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198483
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5744	NC_015942	CCA	2	6	266483	266488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344198483
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5986	NC_015942	AGC	2	6	278016	278021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344198491
5987	NC_015942	TCA	2	6	278065	278070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344198491
5988	NC_015942	TTTGGC	2	12	278104	278115	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	344198491
5989	NC_015942	GCC	2	6	278250	278255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198491
5990	NC_015942	CTG	2	6	278265	278270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198491
5991	NC_015942	GCC	3	9	278308	278316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344198491
5992	NC_015942	GTG	3	9	278332	278340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344198491
5993	NC_015942	CTG	2	6	278364	278369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198491
5994	NC_015942	ACGCTG	2	12	278370	278381	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344198491
5995	NC_015942	CTT	2	6	278393	278398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344198491
5996	NC_015942	CGG	2	6	278414	278419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198491
5997	NC_015942	CGG	2	6	278476	278481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344198491
5998	NC_015942	CG	5	10	278482	278491	0 %	0 %	50 %	50 %	344198491
5999	NC_015942	CTG	2	6	278526	278531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344198491
6000	NC_015942	TGATC	2	10	278555	278564	20 %	40 %	20 %	20 %	344198491

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